Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMPK1P30085 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms