Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms