Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCKSP29966 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARCKSP29966 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms