Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD10P28358 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms