Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA1P20827 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms