Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CD53P19397 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CD53P19397 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD53P19397 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD53P19397 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD53P19397 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms