Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APELAP0DMC3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APELAP0DMC3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms