Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NGFRP08138 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NGFRP08138 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NGFRP08138 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms