Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF1RP07333 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms