Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
NSD2O96028 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NSD2O96028 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NSD2O96028 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NSD2O96028 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NSD2O96028 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSD2O96028 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSD2O96028 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSD2O96028 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSD2O96028 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSD2O96028 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSD2O96028 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NSD2O96028 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSD2O96028 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSD2O96028 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSD2O96028 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NSD2O96028 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NSD2O96028 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NSD2O96028 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSD2O96028 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSD2O96028 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSD2O96028 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSD2O96028 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSD2O96028 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSD2O96028 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSD2O96028 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSD2O96028 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSD2O96028 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSD2O96028 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSD2O96028 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSD2O96028 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSD2O96028 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSD2O96028 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSD2O96028 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSD2O96028 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NSD2O96028 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSD2O96028 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSD2O96028 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSD2O96028 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSD2O96028 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSD2O96028 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSD2O96028 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSD2O96028 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSD2O96028 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSD2O96028 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NSD2O96028 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSD2O96028 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms