Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYF2O95926 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYF2O95926 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYF2O95926 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYF2O95926 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYF2O95926 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYF2O95926 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYF2O95926 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYF2O95926 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYF2O95926 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYF2O95926 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SYF2O95926 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYF2O95926 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYF2O95926 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYF2O95926 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYF2O95926 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYF2O95926 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYF2O95926 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYF2O95926 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYF2O95926 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms