Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB11O95342 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms