Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCAF4O95104 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms