Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPM2O94759 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPM2O94759 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms