Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SURF6O75683 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SURF6O75683 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF6O75683 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF6O75683 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF6O75683 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF6O75683 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF6O75683 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF6O75683 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF6O75683 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF6O75683 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF6O75683 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF6O75683 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF6O75683 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF6O75683 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF6O75683 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SURF6O75683 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SURF6O75683 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF6O75683 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF6O75683 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF6O75683 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF6O75683 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF6O75683 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF6O75683 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF6O75683 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF6O75683 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF6O75683 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF6O75683 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF6O75683 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SURF6O75683 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SURF6O75683 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SURF6O75683 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SURF6O75683 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms