Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN3BO60391 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN3BO60391 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms