Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
KIAA0556O60303 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
KIAA0556O60303 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms