Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAK2O60296 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms