Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COCHO43405 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COCHO43405 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COCHO43405 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COCHO43405 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COCHO43405 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COCHO43405 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COCHO43405 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COCHO43405 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COCHO43405 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COCHO43405 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COCHO43405 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COCHO43405 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COCHO43405 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COCHO43405 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COCHO43405 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
COCHO43405 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COCHO43405 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COCHO43405 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COCHO43405 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COCHO43405 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COCHO43405 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms