Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VGFO15240 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VGFO15240 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
VGFO15240 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VGFO15240 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VGFO15240 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VGFO15240 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VGFO15240 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VGFO15240 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VGFO15240 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VGFO15240 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VGFO15240 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
VGFO15240 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VGFO15240 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
VGFO15240 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VGFO15240 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VGFO15240 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGFO15240 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGFO15240 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGFO15240 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGFO15240 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
VGFO15240 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGFO15240 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGFO15240 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGFO15240 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGFO15240 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGFO15240 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGFO15240 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGFO15240 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGFO15240 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VGFO15240 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGFO15240 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGFO15240 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGFO15240 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGFO15240 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGFO15240 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGFO15240 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGFO15240 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGFO15240 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGFO15240 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGFO15240 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGFO15240 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGFO15240 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGFO15240 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VGFO15240 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VGFO15240 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
VGFO15240 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms