Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP290O15078 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP290O15078 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP290O15078 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP290O15078 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP290O15078 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP290O15078 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP290O15078 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP290O15078 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP290O15078 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP290O15078 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP290O15078 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP290O15078 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP290O15078 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP290O15078 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP290O15078 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP290O15078 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP290O15078 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP290O15078 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CEP290O15078 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CEP290O15078 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CEP290O15078 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP290O15078 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP290O15078 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CEP290O15078 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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