Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3AO14802 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR3AO14802 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms