Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F3O00716 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F3O00716 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F3O00716 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F3O00716 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F3O00716 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F3O00716 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F3O00716 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F3O00716 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F3O00716 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F3O00716 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F3O00716 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F3O00716 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms