Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms