Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP1O00294 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP1O00294 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TULP1O00294 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TULP1O00294 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP1O00294 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP1O00294 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP1O00294 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP1O00294 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP1O00294 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP1O00294 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP1O00294 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP1O00294 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP1O00294 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP1O00294 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP1O00294 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP1O00294 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP1O00294 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms