Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP23O00161 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms