Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms