Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms