Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM4A7MD48 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms