Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD0

IFITM10, Interferon-induced transmembrane protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM10A6NMD0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM10A6NMD0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM10A6NMD0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms