Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM223BA6NKX1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM223BA6NKX1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms