Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP5A6NIR3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms