Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms