Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF316A6NFI3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms