Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC144AA2RUR9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms