Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
EHD3Q9NZN3 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms