Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC010542.5-201ENST00000612427 382 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 MRAS-211ENST00000621127 3801 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01002-216ENST00000632351 572 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC073488.11-201ENST00000633298 754 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC068205.4-201ENST00000637880 804 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1257-205ENST00000515659 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TTC33-205ENST00000636106 2252 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TRHR-202ENST00000518632 1660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL391380.1-201ENST00000439300 1432 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 GPM6B-205ENST00000454189 3957 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 OSGIN2-201ENST00000297438 4209 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ASPH-207ENST00000517847 1947 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PTPDC1-201ENST00000288976 4398 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PSG5-201ENST00000342951 1626 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02282-201ENST00000535153 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 FCAR-201ENST00000345937 608 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RIT1-201ENST00000368322 855 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 BEND6-201ENST00000370745 579 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL356432.2-201ENST00000407841 422 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC008063.1-201ENST00000418335 640 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC008758.2-201ENST00000420038 695 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL445686.1-201ENST00000443086 348 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PRELID1P3-201ENST00000450055 643 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL034397.1-201ENST00000456392 908 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RPL5P17-201ENST00000469685 877 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 IGHVII-22-1-201ENST00000517888 265 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AP006587.2-201ENST00000530696 493 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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TIMMDC1Q9NPL8 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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TIMMDC1Q9NPL8 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC007221.2-201ENST00000634367 948 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 DET1-202ENST00000444300 2154 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 OSGEPL1-204ENST00000519810 2216 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CYCS-201ENST00000305786 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 MEF2C-221ENST00000514015 2772 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 NCOA4-201ENST00000578454 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CDC25C-203ENST00000415130 1556 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 XRCC6P3-201ENST00000422187 1621 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 DCLRE1C-211ENST00000396817 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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