Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC119674.1-201ENST00000641611 1210 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 NELL2-217ENST00000551601 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 GLYATL2-201ENST00000287275 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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GRIK4Q16099 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
GRIK4Q16099 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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