Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms