Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ASIC5-201ENST00000537611 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 RPL5P27-201ENST00000437011 881 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 PRKAR1AP1-201ENST00000441422 1162 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC084878.1-201ENST00000480555 648 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ATP5J2P4-201ENST00000538774 267 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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