Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 PRR32-201ENST00000371125 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC068389.3-201ENST00000373384 529 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RNA5SP297-201ENST00000391029 113 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC096664.1-201ENST00000393996 778 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 GUSBP4-201ENST00000423899 672 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL157400.2-201ENST00000454174 563 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC006387.1-203ENST00000494849 342 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC034207.1-201ENST00000506742 948 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 GNGT2-203ENST00000507680 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC233290.2-201ENST00000552852 390 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC114546.2-201ENST00000560683 477 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CEP85-209ENST00000640292 2286 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 ABI1-209ENST00000376166 3441 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 SLC30A8-201ENST00000427715 5430 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 PROM1-210ENST00000510224 4006 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MAP3K7CL-201ENST00000286791 1725 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CLEC4M-204ENST00000359059 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 GOSR2-232ENST00000640051 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 TAPT1-AS1-201ENST00000570786 2165 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 ABCE1-201ENST00000296577 3921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RPGRIP1L-210ENST00000568653 2429 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 FLJ36000-201ENST00000612344 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CAST-244ENST00000515663 1473 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 PLP1-223ENST00000621218 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 PLCH1-204ENST00000460012 6413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL354732.1-201ENST00000416416 2080 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL031595.3-201ENST00000624919 14262 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 OFCC1-201ENST00000316020 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CENPW-201ENST00000368325 528 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 SUN5-203ENST00000375523 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 LEMD1-206ENST00000391936 727 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 GLRX3P2-201ENST00000405027 1038 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 TRIB2-203ENST00000405331 830 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC004830.1-201ENST00000420449 285 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 ARMC8P1-201ENST00000443069 1289 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 ST3GAL4-219ENST00000534457 987 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CYP1A1-205ENST00000564596 988 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC010719.1-201ENST00000602992 747 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL590560.2-201ENST00000608430 732 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 OFCC1-217ENST00000611763 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 NUDT13-208ENST00000617744 928 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CD28-201ENST00000324106 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 PHACTR1-205ENST00000379350 4784 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 PRCP-202ENST00000393399 2120 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MTA3-205ENST00000407270 2202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
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