Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 TBC1D19-205ENST00000511789 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AL355472.1-201ENST00000451795 575 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AP002026.1-204ENST00000506454 749 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AL592504.1-201ENST00000605319 439 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BNIP1Q12981 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153 ms