Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.9 ms