Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PTPRMP28827 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 NHLRC3-201ENST00000379599 3275 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
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PTPRMP28827 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
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PTPRMP28827 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
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PTPRMP28827 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
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PTPRMP28827 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 DNAH9-201ENST00000262442 13750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PTPRMP28827 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRMP28827 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRMP28827 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRMP28827 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRMP28827 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRMP28827 YWHABP1-201ENST00000445359 727 ntBASIC8.78□□□□□ -1
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PTPRMP28827 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
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PTPRMP28827 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC8.78□□□□□ -1
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PTPRMP28827 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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PTPRMP28827 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRMP28827 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRMP28827 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRMP28827 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRMP28827 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC8.78□□□□□ -1
PTPRMP28827 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRMP28827 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRMP28827 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PTPRMP28827 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1
PTPRMP28827 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
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