Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC02447-201ENST00000499242 1500 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 IGHV4-59-201ENST00000390629 495 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL139806.1-201ENST00000403057 1002 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC123904.1-201ENST00000441072 368 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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