Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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