Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MTND6P16-201ENST00000504006 520 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC025180.1-201ENST00000505701 595 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC034206.1-201ENST00000509372 474 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC023794.3-204ENST00000510754 236 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CCDC32-210ENST00000559911 677 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC008870.2-201ENST00000568262 1024 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC093484.4-201ENST00000583934 461 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CLEC19A-205ENST00000636231 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-204ENST00000395157 2665 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LMLN-202ENST00000332636 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PIGN-230ENST00000638977 4601 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 OR2A4-201ENST00000315453 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SYTL4-204ENST00000372989 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ADGRG6-201ENST00000230173 7026 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MEF2C-221ENST00000514015 2772 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ODF2-220ENST00000604420 3030 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ABCA4-207ENST00000536513 3740 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 GNPAT-201ENST00000366647 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC01555-201ENST00000370624 2884 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CORIN-207ENST00000505909 3018 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN30-211ENST00000610712 3439 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 METTL18-202ENST00000310392 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 TCTN1-201ENST00000377654 1539 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LUARIS-201ENST00000436105 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL354732.1-204ENST00000421020 755 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 BRWD1-AS1-201ENST00000423274 691 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 GH2-202ENST00000423893 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC239860.1-201ENST00000444680 1270 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RPL4P2-201ENST00000447259 1282 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL449212.1-201ENST00000499853 517 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 KCTD21-AS1-204ENST00000528468 554 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 OR4A7P-201ENST00000531463 910 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC090692.1-201ENST00000531569 541 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CCDC32-203ENST00000558113 576 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CCDC32-212ENST00000560305 557 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 C16orf45-203ENST00000561692 534 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 TTN-AS1-210ENST00000578746 677 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MIR3187-201ENST00000583431 70 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC093063.1-201ENST00000599317 363 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC005303.1-201ENST00000607906 740 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PBRM1-208ENST00000410007 4905 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ERI2-215ENST00000569729 2646 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SORCS1-202ENST00000344440 3009 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 IFI44-201ENST00000370747 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 TDRD9-201ENST00000339063 3447 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 NF1P2-201ENST00000556855 2505 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SYNE1-211ENST00000413186 4860 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 GABRR1-202ENST00000435811 3106 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 TRPS1-209ENST00000519674 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MYB-235ENST00000533624 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MYB-238ENST00000534044 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 IL15-207ENST00000514653 1388 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 FANCL-203ENST00000403295 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CTNNA2-217ENST00000540488 2792 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PCDH18-205ENST00000511115 1331 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AMBRA1-206ENST00000528950 4102 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC27-AS1-205ENST00000434897 4660 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms