Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ROPN1B-207ENST00000511082 782 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OR7E2P-201ENST00000533071 889 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC021506.1-201ENST00000581971 597 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL589743.4-201ENST00000610763 586 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC005383.1-201ENST00000622689 534 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TBC1D19-205ENST00000511789 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 HMGB3P1-201ENST00000393368 573 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 GRXCR1-201ENST00000399770 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC023141.1-201ENST00000419418 379 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC00160-201ENST00000430635 693 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OR6M3P-201ENST00000531567 700 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 DRAIC-206ENST00000559029 309 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 MIR205HG-210ENST00000603283 455 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 IZUMO3-203ENST00000604921 743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms