Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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