Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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